कैंसर अस्पताल की इमारत में करीब 20 साल से जलजमाव की समस्या थी। बारिश के दौरान दो से तीन फीट पानी भर जाता था। इससे इमारत के खतरनाक होने का खतरा भी बढ़ गया था और नींव भी कमजोर हो रही थी। इसके बाद मेडिकल कालेज प्रशासन ने इंदौर विकास प्राधिकरण से संपर्क कर सुधार कार्य सौंपा। प्राधिकरण के अधिकारियों ने जलजमाव की समस्या खोजने के लिए इमारत के निर्माण के समय की प्लानिंग देखने के साथ ही पुराने कर्मचारियों से जानकारी ली।इसमें जानकारी मिली कि परिसर में एक कुआं है। इसे ढंक दिया गया है और उस पर शौचालय बना दिया है। कुआं करीब 40 साल पुराना है और भीतर से उसकी दीवारें भी कमजोर हो चुकी हैं। वर्षा के दिनों में कुआं भर जाता है और उसका पानी रिसकर तलघर में आता है, लेकिन कुएं के बारे में किसी को पता नहीं था। प्राधिकरण ने तलघर में भी तीन स्तर पर वाटर प्रूफिंग की है, ताकि पानी नीचे से नहीं आ सके।